Nel 1652, dopo l’apparizione del Venerabile Daniele al novizio John Daurov, le sue sante reliquie furono rinvenute e si scoprirono incorrotte. Furono quindi deposte nel Monastero, vicino all’altare della Cattedrale della Santa Trinità. Le sue reliquie furono riportate alla luce il 18 novembre 1653, e furono autenticate dal Metropolita Jonah di Rostov e Yaroslavl il 30 dicembre.
Molti miracoli e guarigioni avvennero davanti alle sante reliquie di San Daniele. La sua icona taumaturga, dipinta da un iconografo guarito di nome Demetrios, era conservata nel Monastero. Vi era un pozzo che lo stesso Santo aveva scavato, e la sua acqua è miracolosa. I pellegrini la bevevano, vi si immergevano, e i malati ricevevano guarigione dalle loro infermità.
